《企業(yè)會計準(zhǔn)則》和《小企業(yè)會計準(zhǔn)則》對研發(fā)費用的會計核算有明確的規(guī)范。同時，國稅發(fā)〔2008〕116號通知規(guī)定企業(yè)必須對研發(fā)費用實行專賬管理。  因此，企業(yè)首先在會計核算上應(yīng)設(shè)置“研發(fā)支出”科目，或在“管理費用”科目下專設(shè)“研究開發(fā)費用”二級科目，按照研究開發(fā)項目和費用種類分別核算。研究開發(fā)費用的發(fā)生憑證必須真實合法，做到賬證俱全。然后，在此基礎(chǔ)上建立研發(fā)費用臺賬，歸集可加計扣除的研究開發(fā)費用。同時按照國稅發(fā)〔2008〕116號通知附表的規(guī)定項目，準(zhǔn)確填寫年度可加計扣除的各項研發(fā)費用實際發(fā)生金額，并據(jù)此計算研發(fā)費用加計扣除。另外，如果企業(yè)在一個納稅年度內(nèi)進行多個研究開發(fā)活動的，應(yīng)按照不同開發(fā)項目分別歸集可加計扣除的研發(fā)費用額。科目設(shè)置及內(nèi)容歸集：“管理費用——研發(fā)費（研發(fā)項目名稱或登記編號）”科目下設(shè)三級級到六級科目：

根據(jù)研發(fā)形式設(shè)置三級子科目：1、自行開發(fā)；2、委托開發(fā)；3、合作開發(fā)；4、集中開發(fā)。 研發(fā)形式為自行開發(fā)和合作開發(fā)、集中開發(fā)的，應(yīng)設(shè)置四到五級科目，企業(yè)可根據(jù)本企業(yè)實際需要設(shè)定六級科目。

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